Les PME qui remplissent les conditions nécessaires pour figurer dans le registre public des PME innovantes et qui ne figurent pas encore sur aucune des listes publiées peuvent demander à être incluses dans la liste par le biais d'une demande d'enregistrement en tant que PME innovante, en fournissant des documents prouvant qu'elles répondent à l'une des exigences nécessaires à cette fin.
La demande d'enregistrement est gratuite pour les entreprises et la procédure d'enregistrement s'effectue par voie électronique, via le registre public des PME innovantes du ministère de la Science et de l'Innovation.
L'entreprise doit être enregistrée au RUS (registre unifié des candidats) pour pouvoir commencer à demander le sceau.